Quello di Modeling penso sia personalizzabile, anche se non ho mai fatto mi son sempre limitato ad aggiungere icone alla barre in alto, penso che in linea di principio si personalizzi come i menù classici di Office, quindi potresti trovare tutorial che spiegano bene.
Per quanto riguarda la conservazione delle personalizzazioni dovrebbero essere salvate nelle solite cartelle locali customize etc etc, a meno che la software house che ha installato il programma non ha messo le personalizzazioni nel server così ci possono accedere anche altri PC della rete.